Ulrich Mahlert studierte Klavier, Musikwissenschaft sowie Germanistik in Freiburg/Br. Er war u.a. Klavierdozent an der Musikhochschule Freiburg, Redakteur am Südwestfunk Baden-Baden, Wissenschaftlicher Mitarbeiter für Musiktheorie an der Universität Hannover. Von 1984 bis 2016 lehrte er als Professor an der Universität der Künste Berlin Musikpädagogik und leitete den Studiengang Künstlerisch-pädagogische Ausbildung.

Er ist Mitbegründer und -herausgeber der Zeitschrift üben & musizieren (Schott), Autor zahlreicher musikpädagogischer und -wissenschaftlicher Veröffentlichungen sowie Editor diverser Notenausgaben. Seine Arbeitsgebiete sind Musik und Musikpädagogik des 18.-21. Jahrhunderts, Instrumentaldidaktik, Aspekte musikalischer Bildung und Robert Schumann.